Основа — яхонт , старинное название рубина и сапфира. Как и названия других драгоценностей, слово еще с конца XVIII в. часто служило основой фамилий, даваемых священниками выпускникам духовных семинарий: Алмазов, Серебров и др.
Значение слова ЯХОНТОВ в Словаре русских фамилий
Что такое ЯХОНТОВ
Словарь русских фамилий. 2012