Бесспорна основа монах. Но Монахов не мог быть сыном монаха (монашество исключало это), а был сыном Монаха, т. е. это отчество от прозвища Монах, вероятно ироничного.
Значение слова МОНАХОВ в Словаре русских фамилий
Что такое МОНАХОВ
Словарь русских фамилий. 2012