К статье ПОРТУГАЛИЯ: ИСТОРИЯ
Жуан IV был ближайшим португальским потомком Себастьяна по боковой линии и крупнейшим землевладельцем Португалии, но у него не было армии, а казна была пуста. Поскольку Испания в то время была втянута в войну с Францией и занята восстанием в Каталонии, он сумел организовать оборону страны и найти союзников. Союз Португалии с Англией был восстановлен в 1642. Французы, подталкивавшие Португалию к восстановлению независимости, отказались войти в официальный союз. Голландцы, несмотря на враждебное отношение к Испании, продолжали занимать португальские владения в Бразилии до тех пор, пока бразильцы не подняли против них вооруженное восстание. Бразильский губернатор Салвадор Корреа ди Са организовал экспедицию в Африку, чтобы изгнать голландцев из Анголы. Папский престол, находившийся под влиянием Испании, отказался признать Жуана IV. В этой сложной обстановке были предприняты усилия по расширению бразильской торговли. После значительных уступок голландцам с ними был заключен мир. В 1654 был подписан договор с Англией, по которому английским купцам были возвращены привилегии в Лиссабоне, признана находящаяся там же фактория и предоставлена свобода вероисповедания.
После смерти Жуана IV его старший сын Альфонс VI (1656-1683) был еще несовершеннолетним, и вдова Жуана IV Луиза осуществляла регентство. Она тщетно боролась за заключение договора с Францией, но заключила союз с Англией, по которому Карл II женился на ее дочери Катерине Брагансской, получив в качестве приданого не только большую денежную сумму, но также Танжер и Бомбей. Взамен он обязался защищать Португалию, "как если бы она была самой Англией". Карл II прислал солдат для усиления охраны границ Португалии, и английские дипломаты в 1668 добились, чтобы Испания признала независимость Португалии.
Между тем оказалось, что Альфонс VI не способен управлять страной, и от его имени этим занимался граф Каштелу Мельюр. Он организовал женитьбу Альфонса на французской принцессе Мари-Франсуазе-Изабелле Савойской, которая спровоцировала отставку Каштелу Мельюра и добилась развода по причине импотенции Альфонса. Затем она вышла замуж за его младшего брата Педру, который в 1667 был утвержден регентом, а после смерти Альфонса стал королем Педру II (1683-1706). Португалия установила хорошие отношения с Англией и Францией, чтобы нарушить планы Испании. Однако теперь Испания стала менее опасной. Брак с Мари-Франсуазой-Изабеллой расценивался как успех французской политики, но после ее смерти Педру II женился на австрийке. Когда стало ясно, что у испанского короля Карла II не будет наследника, французский король Людовик XIV стал предъявлять претензии к Испании и после смерти Карла в 1700 посадил на испанский престол своего внука, титулованного Филиппом V. Это вызвало тревогу в других европейских государствах, и, когда Англия и Нидерланды поддержали претензии австрийского эрцгерцога Карла, Португалия присоединилась к большому союзу, сформированному для изгнания Бурбонов из Испании. Эрцгерцог прибыл в Португалию, но, хотя англо-португальские войска дважды вступали в Мадрид, им не удалось ни удержать этот город, ни воодушевить испанцев на борьбу с французами. В соответствии с Утрехтским миром 1713 Бурбоны остались на испанском престоле, а португальцы укрепили союз с Англией и Австрией.