I префикс Словообразовательная единица, образующая 1) имена существительные - названия церковных должностей со значением старшинства в звании (протодиакон, протоиерей, протопоп и т.п.) 2) имена существительные - названия лиц, означающие высшую степень проявления ими какого-либо качества, заключенного в мотивирующем имени существительном (протобестия, протоканалья). II префикс Словообразовательная единица, образующая имена существительные со значением первоначальности, исконности по отношению к тому, что названо мотивирующим именем существительным (протозвезды, протозоология, протоистория, прототип и т.п.).
Значение слова ПРОТО- в Новом словаре русского языка Ефремовой
Что такое ПРОТО-
Ефремова. Новый словарь русского языка Ефремовой. 2005