К статье ПЕРУ: ИСТОРИЯ
В 1532 небольшой отряд испанцев во главе с Франсиско Писарро достиг территории Перу. В это время империя была ослаблена только что закончившейся войной между Уаскаром и Атауальпой, двумя претендентами на трон инков. Внутренние распри, а также тот ужас, который испанские пушки и лошади внушали инкам, позволили малочисленным испанцам относительно легко завоевать огромную империю. Испанцы договорились с Атауальпой о встрече для переговоров в Кахамарке. Когда Атауальпа прибыл на условленную встречу 16 ноября 1532, он был захвачен в плен, а его свита перебита. Хотя Атауальпа заплатил за свою свободу поистине сказочный выкуп, наполнив целую комнату золотом и еще одну - серебром, он был убит испанцами в августе 1533. Распад империи ускорился благодаря тому, что испанцы разрушили многие оросительные сооружения и дороги, связывавшие империю. К ноябрю 1533 Куско пал, почти не оказав сопротивления. Кроме того, индейское население начало резко сокращаться в результате занесенных испанцами инфекций.
Одержав победу над инками, испанцы начали воевать между собой из-за добычи, в результате чего Писарро и многие его сподвижники были убиты. Члены правящей династии инков нашли убежище в горах, где в течение примерно сорока лет сопротивлялись испанцам. В 1572 был казнен последний правитель инков Тупак Амарут.
В 1543 Перу было провозглашено вице-королевством, и Лима, "город королей", основанная Писарро в 1535, стала центром испанского владычества в Южной Америке.
Несмотря на жестокую эксплуатацию индейцев до самого начала массового движения за независимость в начале 19 в. в Перу произошло только одно восстание, серьезно угрожавшее власти испанцев. Его возглавил инка, принявший имя Тупак Амару II; восстание продолжалось с 1780 по 1783 и было близко к успеху, однако в конце концов испанцы разгромили повстанцев, а Тупак Амару и тысячи его соратников были подвергнуты жестоким пыткам и казнены.