Вероятная основа — диалектное вологодское слово шамшура — “картавый”, указанное еще 160 лет назад Суровцевым (Труды общества Российской словесности. М., 1822. Ч. 1) — от шамшить — “шамкать, говорить невнятно”. Менее вероятная этимология из шамшура — “женская теплая шапочка, чепчик”, так как фамилии несравнимо реже возникали из именований женщин, чем мужчин. Кроме того, в этом значении словари указывают не шамшура, а шашмура (Сл. Даля).
Значение слова ШАМШУРИН в Словаре русских фамилий
Что такое ШАМШУРИН
Словарь русских фамилий. 2012