Отчество от краткой русской формы Филя, ее образование возможно из многих канонических мужских имен древнегреческого происхождения, в основе которых phileo — “любить”; среди них особенно частыми в России были Филипп, Филарет, Филимон, Филей, Филон, Феофилакт, в святцах записаны еще и Фил, Филокарп, Филомен, Филофей, Филолог, Философ, но употреблялись ли они у русских — пока неизвестно. Та же этимология у фамилии Филькин, Филюшин, Филялин.
Значение слова ФИЛИН в Словаре русских фамилий
Что такое ФИЛИН
Словарь русских фамилий. 2012