К статье ЭРИТРЕЯ: ИСТОРИЯ
Заняв Асмэру, НФОЭ не торопился с провозглашением независимости Эритреи. Между НФОЭ (ныне Временным правительством Эритреи) и новым коалиционным правительством в Аддис-Абебе (Переходным правительством Эфиопии) была достигнута договоренность о том, что 23-25 апреля 1993 в Эритрее будет проведен референдум, на котором жители страны выскажутся по вопросу о независимости. Такое решение давало НФОЭ возможность провозгласить независимость Эритреи легитимным и демократическим путем, а правительству Эфиопии - укрепить свои позиции, не занимаясь болезненным вопросом об эритрейской независимости. Предполагалось, что после двухлетней отсрочки будет принято более взвешенное решение.
Референдум состоялся в намеченные сроки. Многочисленные наблюдатели от международных и региональных организаций признали, что процесс всенародного волеизъявления был свободным и честным. 27 апреля 1993 были обнародованы официальные результаты референдума: 99,8% принявших в нем участие избирателей высказались за независимость страны. Эритрея официально была провозглашена суверенным государством. Вслед за этим эфиопская и эритрейская стороны подтвердили ранее достигнутые взаимовыгодные договоренности, предусматривавшие, в частности, свободное использование Эфиопией порта Асэб для внешнеторговых операций, право государственной эфиопской авиакомпании "Эфиопия эйрлайнз" пользоваться аэродромом в Асмэре, хождение в Эритрее эфиопской денежной единицы бырра, а также свободное пересечение эфиопско-эритрейской границы гражданами обеих стран.
После семи лет взаимовыгодного экономического и политического сотрудничества отношения между обеими странами вступили в полосу кризиса, вызванного пограничным конфликтом в мае 1998. Непродолжительные, но интенсивные вооруженные действия в районе эфиопско-эритрейской границы привели к гибели сотен военнослужащих с обеих сторон. По данным международной организации по правам человека "Эмнести интернэшнл", из Эфиопии на родину были депортированы тысячи эритрейцев.