Фамилия записана в Валдайском уезде Новгородской губернии в 1914 г. Возможно, есть связь с названием старинного оружия: шестопер — “род булавы с наконечником в форме пучка перьев стрелы, употреблявшийся как холодное оружие” (Сл. Ушакова). Вероятнее всего же связь с костромским (по В. И. Далю) словом шестипер в значении “шерстобит”, т. е. “взбивающий шерсть”.
Значение слова ШЕСТИПЕРОВ в Словаре русских фамилий
Что такое ШЕСТИПЕРОВ
Словарь русских фамилий. 2012