Возможна связь фамилии через прозвище со скобель — “нож для строгания”, но вероятнее отчество от прозвища Скобель, также связанного с глаголом скоблить, но в иных значениях (например, скобель — “чешущийся”).
Значение слова СКОБЕЛЕВ в Словаре русских фамилий
Что такое СКОБЕЛЕВ
Словарь русских фамилий. 2012