Отчество от формы Фомяга церковного мужского имени Фома (см. Фомочкин ); наиболее характерна для северного и отчасти среднего Поволжья, в Зауралье (Курган. обл.) принесена миграцией населения.
Значение слова ФОМЯГИН в Словаре русских фамилий
Что такое ФОМЯГИН
Словарь русских фамилий. 2012