Фамилия, очевидно, возникла из насмешливого именования любителя кутаться. Она старинна — еще в документе 1652 г. упомянут Федка Трехшубин по Усть-Уренской слободе Симбирского уезда — Ульяновская область (В. Холмогоров).
Значение слова ТРЁХШУБИН в Словаре русских фамилий
Что такое ТРЁХШУБИН
Словарь русских фамилий. 2012