Очень не любили на Руси нерях и замарашек, людей не аккуратных, нечистоплотных. В каждом диалекте для них по нескольку определений. Вот некоторые: чупа, чупаха, чупка, чупашка. А в воронежских говорах чупить – ‘проказить’. Одно из этих значений в образованных от прозвищ фамилиях: Чупаков, Чупарин, Чупахин, Чупеев, Чупин, Чупов.
Значение слова ЧУПИН в Энциклопедии русских фамилий, тайн происхождения и значений
Что такое ЧУПИН
Энциклопедия русских фамилий, тайны происхождения и значения. 2012