Понятно, что слово хан из тюркских языков. Проникло в русский и, поскольку означало человека высокопоставленного, стало личным нехристианским именем, как и Ханай. Отсюда фамилии – Ханаев, Ханов.
Значение слова ХАНАЕВ в Энциклопедии фамилий
Что такое ХАНАЕВ
Энциклопедия фамилий. 2012