Имя Иван (от древнееврейского ‘благодать Божия’) имеет множество производных форм. Трудно даже предположить, что фамилии Ишунин, Ишутин как-то связаны с этим именем. Однако это так. В старину Ивана ласково называли Ишуня, Ишута.
Значение слова ИШУНИН в Энциклопедии фамилий
Что такое ИШУНИН
Энциклопедия фамилий. 2012